Возможно виндовс обноружил сбойные сектора на диске f или ещё что-то подожди пока он всё проверит (даже если придется долго ждать). Потам должно всё пройти. Если не пройдет скажешь, будем дальше думать.
человек говорит, сто у него чекдиск запускается всегда, так что это не есть решение проблеммы. Я в своей практике встречал такую ХР, которая при каждой перезагрузге запускала чекдиск, но т.к. там была хоме эдишин, а меня просили поставить профешионал, проблема решилась переустановкой винды.
Как вариант могу посоветовать поюзать программу Tweak XP, там много всего настраивается, вроде бы и проверка дисков при запуске. Также можно поюзать утилиту msconfig, ну и всякие там настроечные файлы поковырять.