проблему нашел - всё дело в "волшебных пузырьках"

, а точнее в Windows File Cache.
Похоже что проблема возникает лавинообразно, т.к. программы которые крутятся на серваке ведут очень много журналов,
отсюда проблема с обработкой кэшем.
Вообще выглядит следующим образом:
Сначала возрастает значение счетчика (Perfomance) Physical disc -> Disc write/sec, одновременно с ним нарастает cache -> sync pin read/sec,
и спустя некоторое время (примерно 40-45 секунд) происходит зависание, т.е. возрастает время в priveleged time.
Судя по всему кэш сбрасывается на диск.
Однако не понятно почему делая в программах сброс (flush) данных на диск принудительно не помогает, решить проблему!!!
Но если воспользоваться программой sync (
www.sysinternals.com), в начале этого роста то зависания не происходит.