прочел статью что программы на сервер ставятся несколько иначе.
Этот режим создан для того, чтобы настройки программ, которые создаются пользователю, из-под которого выполняется установка, копировались остальным пользователям, которые будут входить на TS.
Как работает: мониторит папки в профиле пользователя и ключ реестра HKCU.
Предназначен для кривых программ ("правильный" софт пишет дефолтные установки куда-то в HKLM и оттуда их копирует в HKCU при первом запуске, если не находит там своего ключа).
Например для установки стандартных конфигураций 1С этот режим даже вреден (т.к. обычно база после установки переносится и каталог переименовывается - а при включении этого режима TS всем пользователям пропишет в список баз чистую и демо вновь установленные конфигурации).