maa, в образе ничто не сохраняется.  Статическую настройку IP адреса и прочие настройки надо прописать в файлы реестра проекта.  Идея такая.  Загружаеешь образ, настраиваешь, затем удалённо заходишь в реестр эмулятора и скачиваешь изменения.  Эти изменения и надо прописать в реестр (хотя с сетевой картой, насколько я помню, так просто не получилось).
Есть другой способ.  Написать приложение, которое при запуске делает нужные операции, и прописать его в ключ Autostart реестра.  Так мы заводили пользователя для NTLM, копирование записей реестра не помогало.
По моему, для перезагрузки надо добавить Power Management (или как он называется в Platform Builder'е)
Представляешь, только сегодня потёр остатки проекта, который делали для Windows CE 

  Поэтому более точно подсказать не могу.  
Твоя система на работе соответствует требованиям к CEPC?  Возможно, для Elitegroup нет поддержки в драйверах IDE