Как же не слышать

Она в себя включает все, но как показывает опыт - далеко не всегда это все нужно.
Как я писал - расчет ЗП в том виде, как он реализован в ЗиК и комплексной нужен если есть посменный (почасовый) учет. Если только ставки на месяц - достаточно бух.
Один из главных ее минусов был (из-за чего ее не любят бухгалтера) - это отсутствие аналитики на товарных счетах (в последних версиях уже исправили)
Потом - ни в коем случае нельзя бухам давать править какие-то товарные остатки операциями (все отчеты по товарным остаткам заточены под регистры, а не бух.счета)
Усложненный механизм формирования проводок (не сразу, а после ввода документов Торг->Бух, Зарплата->Бух): сделано для ускорения оперативной работы
Сложное сворачивание базы (см. коммент про регистры в соответствующей теме)
Более быстрое "вырастание", более долгий пересчет остатков (опять регистры)
Плюсы - (ИМХО):
то, что все вместе;
много разных торговых отчетов и аналитик.
ИМХО - я только 1 раз (на заре своей практики) пытался внедрить комплексную, теперь предпочитаю дописывать стандартную бух под нужды пользователей