Да документ можно сохранять в справочник. Для этого нужно создать реквизит в справочнике соответствующего типа.
Так сохраняется ссылка на документ, т.е. если документ будет изменен - то и по ссылке из справочника мы увидим измененную копию, а ИМХО по условиям задачи нужно не это...
Will, в
БСП (библиотека стандартных подсистем) есть такая подсистема как версионирование объектов. Ее (как впрочем и другие отдельные подсистемы) можно легко из этой библиотеки прикрутить к отдельно взятой конфигурации. Суть ее в следующем: в отдельном регистре сведений сохраняется все версии отмеченных объектов (документов, справочников) и потом можно построить отчет по различиям между любыми версиями.