Если эти элементы нужно оставить в базе именно с такими кодами - тогда нужно будет немножко менять конфигурацию:
в процедуру ПриНачалеРаботыСистемы() (в глобальном модуле) нужно добавить следующую строку:
ПрефиксАвтонумерации)"Справочник.Тест", "0":;
Но! первый 0 уже не будет увеличиваться, т.е. если коды 4-значные (как написано) то после номера 0999 все таки создастся номер 1000, а вот следующий элемент тоже будет иметь номер 1000 и не захочет сохраняться (нарушение уникальности, если стоит запрет на одинаковые коды).
Если этот вопрос принципиален (ожидается к-во элементов более 1000) тогда пиши - придумаем как решить и это